XSS'ning oldini olish ba'zan oson, ba'zan esa ilova murakkabligi va foydalanuvchi ma'lumotini qanday boshqarishiga qarab ancha qiyin. Odatda quyidagi choralar kombinatsiyasi kerak:
Content-Type va X-Content-Type-Options sarlavhaları brauzer javobni siz mo'ljallagan tarzda talqin qilishini ta'minlaydi.Kiritmani faqat ruxsat etilgan belgilar oq ro'yxati bilan filtrlang. HTML kontekstlar uchun chiqishni HTML-encode qiling (masalan PHP'da htmlentities, Java'da Google Guava), JavaScript kontekstlar uchun esa JavaScript Unicode escape'lardan foydalaning. DOM-based XSS'ning oldini olish uchun ishonchsiz ma'lumotni xavfli sink'larga (innerHTML, eval) uzatishdan saqlaning.